Genetic Signatures成立于2001年，由Geoffrey Grigg博士（原澳大利亞聯(lián)邦科學(xué)與工業(yè)研究組織（CSIRO）分子生物學(xué)部主任）創(chuàng)立。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞硫酸氫鹽法，由Grigg博士在英國(guó)劍橋設(shè)想，并被減少到CSIRO實(shí)驗(yàn)室的實(shí)踐中[1]。初的方法隨后得到改進(jìn)，這些改進(jìn)導(dǎo)致了遺傳簽名MethylEasy™DNA亞硫酸氫鈉修飾產(chǎn)品系列的開(kāi)發(fā)和發(fā)布。
由于改進(jìn)的轉(zhuǎn)化方法和用于胞嘧啶甲基化檢測(cè)的應(yīng)用，發(fā)現(xiàn)了一個(gè)有趣的發(fā)現(xiàn)：通過(guò)亞硫酸氫鈉處理微生物DNA能夠?qū)⑺姆N核酸堿基還原成僅三個(gè)堿基，通過(guò)將胞嘧啶轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶。該技術(shù)被稱為3base ™，是我們的EasyScreen ™病原體檢測(cè)試劑盒的基石。
此后，遺傳標(biāo)志開(kāi)發(fā)并商業(yè)化了一套基于EasyScreen ™實(shí)時(shí)PCR的產(chǎn)品，用于常規(guī)檢測(cè)傳染病。EasyScreen ™產(chǎn)品為醫(yī)院和病理實(shí)驗(yàn)室提供了分子工具，可在快速高通量的環(huán)境中篩查各種傳染性病原體。
胃腸疾病可能由各種各樣的感染因素引起，包括病毒，細(xì)菌和原生動(dòng)物。因此，傳染性胃腸疾病的診斷可能具有挑戰(zhàn)性，并且涉及微生物學(xué)，病毒學(xué)和寄生蟲(chóng)學(xué)方面的專家。
據(jù)估計(jì)，澳大利亞每年有1680萬(wàn)胃腸炎病例，導(dǎo)致醫(yī)院急診科就診25萬(wàn)人，住院15,000人，死亡80人[1]。
為了簡(jiǎn)化感染性胃腸道疾病病原體的檢測(cè)，我們開(kāi)發(fā)了 EasyScreen™ 實(shí)時(shí)PCR篩選檢測(cè)方法，用于所有主要胃腸炎病原體。所有的分析方法都采用通用樣品處理方法，并采用我們之前描述的 3base™ 技術(shù) [2]。
傳統(tǒng)的胃腸炎診斷在某些情況下可能需要長(zhǎng)達(dá)5天[3]才能提供明確的結(jié)果。為了減少這種情況，我們的實(shí)驗(yàn)提供了樣品，可以在3小時(shí)內(nèi)完成結(jié)果周轉(zhuǎn)時(shí)間。
遺傳特征 EasyScreen ™腸道病原體檢測(cè)試劑盒具有以下優(yōu)點(diǎn)：
該 EasyScreen™ 腸道病原體檢測(cè)試劑盒包括：
| 產(chǎn)品＃ | EasyScreen™套件 | 檢測(cè)到微生物 |
|---|---|---|
| EB001和EB001-HT | 腸道細(xì)菌檢測(cè) | （i）沙門氏菌屬 （ii）彎曲桿菌屬（Campylobacter spp。） （iii）痢疾桿菌/腸內(nèi)侵襲性大腸桿菌（EIEC） （iv）小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌。 （v）產(chǎn)毒的艱難梭菌和 （vi）單核細(xì)胞增生李斯特菌 |
| EP001和EP001-HT | 腸道原生動(dòng)物檢測(cè) | （i）隱孢子蟲(chóng)屬， （ii）腸道賈第蟲(chóng)， （iii）脆弱東部阿米巴， （iv）溶組織內(nèi)阿米巴，和 （v）人芽囊原蟲(chóng)（Blastocystis hominis） |
| EV002和EV002-HT | 腸道病毒檢測(cè) | （i）諾如病毒GI （ii）諾如病毒GII （iii）星狀病毒 （iv）輪狀病毒A （v ）沙波病毒 （vi）腸病毒 （vii）博卡 病毒（viii）腺病毒和 （ix）腺病毒（僅40 + 41） |
| CDD001 | 艱難梭菌檢測(cè) | 致病性艱難梭菌（針對(duì)tcdA和tcdB） |
| CDD002 | 艱難梭菌反射 | 超致病性艱難梭菌包括 （i）位置117處的tcdC基因缺失， （ii）二元毒素基因（cdtA）和 （iii）gyrA基因突變（氟喹諾酮耐藥性）的核糖體027和078 ， |
對(duì)于HT（384孔格式）試劑盒，所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs。
所有 EasyScreen™ 腸道病原體檢測(cè)試劑盒可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒制備的核酸 。
有關(guān)EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)的兼容性的更多信息， 請(qǐng)?jiān)L問(wèn)我們的EasyScreen™ 工作流程頁(yè)面。
[1]來(lái)源：澳大利亞政府衛(wèi)生與老齡部，“澳大利亞食源性疾病的年成本”，2006年3月
[2] Baleriola C，Millar D，Melki J，Coulston N，Altman P，Rismanto N和Rawlinson W.2008。新型HPV測(cè)試與Hybrid Capture II（hcII）和參考PCR方法的比較顯示高特異性和陽(yáng)性對(duì)13例高危人乳頭瘤病毒感染的預(yù)測(cè)價(jià)值。J. Clin。病毒學(xué)雜志。42：22-6 2008
[3] Cunningham SA，Sloan LM，Nyre LM，Vetter EA，Mandrekar J和Pa R. 2010.三小時(shí)分子檢測(cè)糞便中彎曲桿菌，沙門氏菌，耶爾森氏菌和志賀菌的準(zhǔn)確性與培養(yǎng)物一樣高。J. Clin。微。48：2929-33
英文信息如下：
| Product | EasyScreen™ Kit | Microorganisms Detected |
|---|---|---|
| EB001 & EB001-HT | Enteric Bacteria Detection | (i) Salmonella spp. (ii) Campylobacter spp. (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC) (iv) Yersinia enterocolitica. (v) toxigenic C. difficile and (vi) Listeria monocytogenes |
| EP001 & EP001-HT | Enteric Protozoan Detection | (i) Cryptosporidium spp. (ii) Giardia intestinalis (iii) Dientamoeba fragilis (iv) Entamoeba histolytica and (v) Blastocystis hominis |
| EV002 & EV002-HT | Enteric Viral Detection | (i) Norovirus GI (ii) Norovirus GII (iii) Astrovirus (iv) Rotavirus A (v) Sapovirus (vi) Enterovirus (vii) Bocavirus (viii) Adenovirus and (ix) Adenovirus (40 + 41 only) |
| CDD001 | C. difficile Detection | Toxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB) |
| CDD002 | C. difficile Reflex | Hypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance) |
對(duì)于HT（384孔格式）試劑盒，所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs
所有 EasyScreen™ 病原體檢測(cè)試劑盒都可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒準(zhǔn)備的 樣品。
有關(guān)EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)的兼容性的更多信息， 請(qǐng)?jiān)L問(wèn)我們的 EasyScreen™ 工作流程頁(yè)面。
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